三宝医馆是一部剧情片，三宝从小被师傅带大，除了讲故事和医学之外，他对外界的人情世故一概不了解。不过，由于他为人忠厚、医术高超，大家都尊他为神医。在开设三宝医馆的过程中，三宝偶然救了一名险遭灭门惨祸的小女孩——温柔，两人结为忘年之交，但三宝却也从此卷入一场阴谋，屡遭杀手追杀……
